Prof.Dr. Tarkan Karakan 1994 yılında Hacettepe ingilizce Tıp Fakültesi mezun oldu, 1994 ile 2000 yılları arasında Gazi Üniversitesi İç Hastalıkları Anabilim Dalı’nda araştırma görevlisi olarak çalıştı.

2000 ve 2002 arasında Ankara Bayındır Hastanesi Gastroenteroloji Bölümünde çalıştı.
2002-2005 yıllarında Gazi Üniversitesi Gastroenteroloji Bilim Dalı’nda yandal asistanlığını tamamlayarak, 2005 yılından itibaren aynı bölümde çalışmalarına devam etti. 2008 yılında “Doçent” ünvanı alarak, halen Gazi Üniveristesi Gastroenteroloji Bilim Dalı’nda öğretim üyesi olarak çalışmalarına devam etmektedir.

2009 ve 2010 yıllarında Brüksel’de ileri endoskopi kursuna katılmış olan Prof.Dr Tarkan Karakan, 2011 yılında 3 ay süre ile Endoskopik ultrasonografi alanında ABD’de Johns Hopkins Üniversitesi’nde gözlemci olarak bulunmuştur.
İlgi alanları endosnografi, klinik nutrisyon ve barsak florası- probiyotiklerdir.